| Site | Région | Type | Date | Superficie (ha) | Lien | Notes | Coordonnées | Illus. |
| Églises baroques des Philippines (extension) | Vallée de Cagayan, Visayas centrales | Culturel
(i), (iii), (iv), (v), (vi) | 2006 | | 3860 | Église Patrocinio de Maria de Boljoon, Église La Inmaculada Concepcion de Guiuan, Église San Pedro Apostol de Loboc, Église San Isidro Labrador de Lazi, Église San Mattias de Tumauini | |  |
| Grottes funéraires à momies de Kabayan | Cordillère | Culturel
(i), (ii), (iii), (iv), (v), (vi) | 2006 | | 2070 | | 16° 33′ nord, 120° 45′ est | |
| Le complexe de la grotte de Tabon et tout Lipuun | MIMAROPA | Culturel
(ii), (iii), (iv), (v) | 2006 | | 1860 | | 9° 17′ 24″ nord, 117° 58′ 37″ est | |
| Paysages terrestres et maritimes protégés de Batanes | Vallée de Cagayan | Culturel | 1993 | | 521 | | | |
| Pétroglyphes et pétrographes des Philippines | Divers lieux | Culturel
(iii) | 2006 | | 5018 | |  |
| Sites archéologiques de Butuan | Caraga | Culturel
(iii), (iv), (v) | 2006 | | 2071 | | 8° 57′ 00″ nord, 125° 29′ 56″ est | |
| Sites archéologiques paléolithiques de la vallée de Cagayan | Vallée de Cagayan | Culturel
(ii), (iii), (iv), (v) | 2006 | | 2069 | | | |
| Sites d'amas coquilliers néolithiques des municipalités de Lal-Lo et Gattaran | Vallée de Cagayan | Culturel
(ii), (iii), (iv), (v) | 2006 | | 5019 | | 18° 12′ 04″ nord, 121° 23′ 24″ est | |
| Monument naturel de Chocolate Hills | Visayas centrales | Naturel
(vii), (viii) | 2006 | | 5024 | | 9° 55′ 01″ nord, 124° 10′ 01″ est |  |
| Parc national des monts Iglit-Baco | MIMAROPA | Naturel
(ix), (x) | 2006 | | 5036 | | 6° 22′ 01″ nord, 125° 04′ 59″ est | |
| Parc national du mont Pulag | Cordillère, vallée de Cagayan | Naturel
(ix), (x) | 2006 | | 5030 | | 16° 30′ 36″ nord, 120° 50′ 20″ est |  |
| Parc naturel des monts Malindang | Mindanao du Nord | Naturel
(vii), (ix), (x) | 2006 | | 5029 | | 8° 17′ 31″ nord, 123° 37′ 30″ est | |
| Parc naturel du nord de la Sierra Madre et zones extérieures incluses dans la zone tampon | Luçon centrale | Naturel
(ix), (x) | 2006 | | 5037 | | 17° 01′ 23″ nord, 121° 55′ 34″ est | |
| Parc naturel du récif d'Apo | MIMAROPA | Naturel
(vii), (ix), (x) | 2006 | | 5033 | | 12° 44′ 46″ nord, 120° 23′ 46″ est | |
| Parc naturel du volcan Mayon | Bicol | Naturel
(vii), (x) | 2015 | | 6007 | | |  |
| Paysage protégé du mont Mantalingahan | Palawan | Naturel
(ix), (x) | 2015 | | 6006 | | |  |
| Sanctuaire de la vie sauvage des îles Turtle | ARMM | Naturel
(ix), (x) | 2015 | | 6008 | | 6° 10′ 01″ nord, 118° 10′ 01″ est | |
| Zone protégée El Nido-Taytay | CALABARZON | Naturel
(ix), (x) | 2006 | | 5034 | | 11° 13′ 59″ nord, 119° 25′ 01″ est | |
| Zone biotique naturelle de l'île Coron | CALABARZON | Mixte
(iii), (ix), (x) | 2006 | | 5035 | | 11° 54′ nord, 120° 15′ est |  |
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