Рекомбиназная полимеразная амплификация — Википедия

Рекомбиназная полимеразная амплификация (англ. Recombinase Polymerase Amplification, RPA) представляет собой альтернативу полимеразной цепной реакции. Технология RPA обеспечивает умножение генетического материала менее чем за 15 минут^[1], а сама реакция осуществляется в изотермических условиях. При добавлении обратной транскриптазы к реакционной смеси посредством RPA возможно определять РНК, так же как и ДНК, без необходимости в отдельной процедуре получения кДНК. Поскольку реакция изотермическая, для неё можно использовать более дешевое и простое оборудования, по сравнению с ПЦР^[2]^[3]^[4]^[5]^[6]^[7]. Оптимальный диапазон температур 37−42 °С, но реакция идёт с небольшой скоростью и при комнатной температуре. Подобное преимущество делает RPA превосходным кандидатом для разработки недорогих, быстрых, «полевых» молекулярных диагностических тестов. Методика RPA разработана биотехнологической компанией TwistDX LTD, находящейся в Кембридже, Великобритания.

Примечания[править | править код]

↑ ЭКСПРЕСС-ТЕСТ ОБНАРУЖИТ ДНК ВИРУСА БЕЗ ПЦР (неопр.). chemport.ru (4 февраля 2015). Дата обращения: 6 октября 2015. Архивировано 6 октября 2015 года.
↑ Zachary Austin Crannell, Brittany Rohrman, Rebecca Richards-Kortum. Quantification of HIV-1 DNA Using Real-Time Recombinase Polymerase Amplification // Analytical Chemistry. — 2014-06-17. — Т. 86, вып. 12. — С. 5615—5619. — ISSN 0003-2700. — doi:10.1021/ac5011298.
↑ Liu, L., Wang, J., Geng, Y., Wang, J., Li, R., Shi, R., & Yuan, W. (2018). Equipment-free recombinase polymerase amplification assay using body heat for visual and rapid point-of-need detection of canine parvovirus 2. Molecular and cellular probes, 39, 41-46.PMID 29705183 PMC 7127419 doi:10.1016/j.mcp.2018.04.004
↑ Qin, Z., Xue, L., Cai, W., Gao, J., Jiang, Y., Yang, J., ... & Wu, Q. (2021). Development of a recombinase-aided amplification assay for rapid detection of human norovirus GII. 4. BMC Infectious Diseases, 21(1), 1-8. PMID 33750333 PMC 7941963 doi:10.1186/s12879-021-05942-x
↑ Zhang, W., Feng, Y., Zhao, H., Yan, C., Feng, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). A Recombinase Aided Amplification Assay for Rapid Detection of the Klebsiella pneumoniae Carbapenemase Gene and Its Characteristics in Klebsiella pneumoniae. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 869. PMID 34616692 PMC 8488121 doi:10.3389/fcimb.2021.746325
↑ Feng, Y., Xue, G., Feng, J., Yan, C., Cui, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). Rapid Detection of New Delhi Metallo-β-Lactamase Gene Using Recombinase-Aided Amplification Directly on Clinical Samples From Children. Frontiers in microbiology, 2087. PMID 34367092 PMC 8339468 doi:10.3389/fmicb.2021.691289
↑ Li, F., He, P., Xiong, D., Lou, Y., Pu, Q., Zhang, H., ... & Yu, J. (2021). A Reverse Transcription Recombinase-Aided Amplification Method for Rapid and Point-of-Care Detection of SARS-CoV-2, including Variants. Viruses, 13(9), 1875. PMID 34578456 PMC 8472806 doi:10.3390/v13091875

[1] ЭКСПРЕСС-ТЕСТ ОБНАРУЖИТ ДНК ВИРУСА БЕЗ ПЦР (неопр.). chemport.ru (4 февраля 2015). Дата обращения: 6 октября 2015. Архивировано 6 октября 2015 года.

[2] Zachary Austin Crannell, Brittany Rohrman, Rebecca Richards-Kortum. Quantification of HIV-1 DNA Using Real-Time Recombinase Polymerase Amplification // Analytical Chemistry. — 2014-06-17. — Т. 86, вып. 12. — С. 5615—5619. — ISSN 0003-2700. — doi:10.1021/ac5011298.

[3] Liu, L., Wang, J., Geng, Y., Wang, J., Li, R., Shi, R., & Yuan, W. (2018). Equipment-free recombinase polymerase amplification assay using body heat for visual and rapid point-of-need detection of canine parvovirus 2. Molecular and cellular probes, 39, 41-46.PMID 29705183 PMC 7127419 doi:10.1016/j.mcp.2018.04.004

[4] Qin, Z., Xue, L., Cai, W., Gao, J., Jiang, Y., Yang, J., ... & Wu, Q. (2021). Development of a recombinase-aided amplification assay for rapid detection of human norovirus GII. 4. BMC Infectious Diseases, 21(1), 1-8. PMID 33750333 PMC 7941963 doi:10.1186/s12879-021-05942-x

[5] Zhang, W., Feng, Y., Zhao, H., Yan, C., Feng, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). A Recombinase Aided Amplification Assay for Rapid Detection of the Klebsiella pneumoniae Carbapenemase Gene and Its Characteristics in Klebsiella pneumoniae. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 869. PMID 34616692 PMC 8488121 doi:10.3389/fcimb.2021.746325

[6] Feng, Y., Xue, G., Feng, J., Yan, C., Cui, J., Gan, L., ... & Yuan, J. (2021). Rapid Detection of New Delhi Metallo-β-Lactamase Gene Using Recombinase-Aided Amplification Directly on Clinical Samples From Children. Frontiers in microbiology, 2087. PMID 34367092 PMC 8339468 doi:10.3389/fmicb.2021.691289

[7] Li, F., He, P., Xiong, D., Lou, Y., Pu, Q., Zhang, H., ... & Yu, J. (2021). A Reverse Transcription Recombinase-Aided Amplification Method for Rapid and Point-of-Care Detection of SARS-CoV-2, including Variants. Viruses, 13(9), 1875. PMID 34578456 PMC 8472806 doi:10.3390/v13091875

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]