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通用蛋白质资源库
UniProt
内容
获取的数据类型Protein annotation
有机体（生物）所有
相关信息
研究中心英国欧洲分子生物学实验室-欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）、瑞士生物信息研究所（SIB）（英语：Swiss Institute of Bioinformatics）、美国蛋白质信息资源（PIR）（英语：Protein Information Resource）
主要参考文献（引用）Ongoing and future developments at the Universal Protein Resource[1]
访问
数据格式Custom flat file, FASTA（英语：FASTA）, GFF（英语：GFF）, RDF, XML.
网站www.uniprot.org
下载网址www.uniprot.org/downloads&用於下載完整的數據集ftp.uniprot.org
网络服务网址是 – JAVA应用程序接口在這裡看到信息&表現層狀態轉換在這裡看到信息
工具
网络高級搜索，BLAST，ClustalO，批量檢索/下載，ID映射
其它信息
许可創作共用署名-禁止改作
軟件版本號是
数据发布频率4周一次
管理政策是 – 手動和自動。 數據庫監護人和計算算法生成的自動註釋規則。
可否列为书签是 – 個別蛋白質條目和搜索

通用蛋白质资源库（英語：Universal Protein resource，直译：「通用／联合蛋白质资源」，混成词：UniProt），是通过结合瑞士蛋白质数据库（Swiss-Prot）、欧洲分子生物学实验室核苷酸序列数据库与蛋白质翻译库（Translation of European Molecular Biology Laboratory nucleotide sequence database，缩写TrEMBL）和蛋白质信息资源-蛋白质序列数据库（PIR-PSD）创建的蛋白质数据中央数据库，一个全面的，高质量的，免费使用蛋白质序列与功能信息数据，许多内容来自基因组计划，它还包含了大量来自研究文献的关于蛋白的生物学功能信息。

UniProt共同体

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UniProt共同体由欧洲生物信息研究所（EBI），瑞士生物信息研究所（SIB）（英语：Swiss Institute of Bioinformatics），以及美国蛋白质信息资源（PIR）（英语：Protein Information Resource）组成。欧洲生物信息研究所坐落于英国欣克斯顿（英语：Hinxton）的惠康信任基因组园区（英语：Wellcome Genome Campus），拥有大量的生物信息学数据库及服务资源。瑞士生物信息研究所位于瑞士的日内瓦，维持专家蛋白质分析系统（英语：ExPASy），该系统是一个蛋白质组学工具和数据库资源中心服务器的运作。PIR由美国华盛顿特区乔治城大学医学中心的国家生物医学研究基金会 (National Biomedical Research Foundation，NBRF) 主办，是最早的蛋白质序列数据库，玛格丽特·戴霍夫于1965年首次出版的《蛋白质序列和结构图集》（Atlas of Protein Sequence and Structure）。2002年，EBI，SIB和PIR联合成为UniProt共同体[2]。

UniProt数据库的根源

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每个共同体成员都积极参与蛋白质数据库维护和注释。 直到最近，欧洲生物信息研究所（EBI）和瑞士生物信息研究所（SIB）一起产生了瑞士蛋白质数据库（Swiss-Prot）和TrEMBL数据库，而蛋白质信息资源（PIR）产生了蛋白质序列数据库（Protein Information Resource-Protein Sequence Database，PIR-PSD）[3][4][5]。 这些数据库与不同的蛋白质序列覆盖和注释优先级共存。

参考文献

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  1. ^ PMID 21051339（PMID 21051339）
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  2. ^ 2002 Release: NHGRI Funds Global Protein Database. National Human Genome Research Institute (NHGRI). [14 April 2018]. （原始内容存档于2015-09-24）. 
  3. ^ O'Donovan, C.; Martin, M. J.; Gattiker, A.; Gasteiger, E.; Bairoch, A.; Apweiler, R. High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL. Briefings in Bioinformatics. 2002, 3 (3): 275–284. PMID 12230036. doi:10.1093/bib/3.3.275. 
  4. ^ Wu, C. H.; Yeh, L. S.; Huang, H.; Arminski, L.; Castro-Alvear, J.; Chen, Y.; Hu, Z.; Kourtesis, P.; Ledley, R. S.; Suzek, B. E.; Vinayaka, C. R.; Zhang, J.; Barker, W. C. The Protein Information Resource. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 345–347. PMC 165487 可免费查阅. PMID 12520019. doi:10.1093/nar/gkg040. 
  5. ^ Boeckmann, B.; Bairoch, A.; Apweiler, R.; Blatter, M. C.; Estreicher, A.; Gasteiger, E.; Martin, M. J.; Michoud, K.; O'Donovan, C.; Phan, I.; Pilbout, S.; Schneider, M. The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003. Nucleic Acids Research. 2003, 31 (1): 365–370. PMC 165542 可免费查阅. PMID 12520024. doi:10.1093/nar/gkg095. 

外部链接

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