IRF8 — Вікіпедія

IRF8
Ідентифікатори
Символи	IRF8, H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatory factor 8
Зовнішні ІД	OMIM: 601565 MGI: 96395 HomoloGene: 1629 GeneCards: IRF8
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічний лімфолейкоз, Інфекція, яку спричинює вірус Епштейна — Барр
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• myeloid cell differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to bacterium; • positive regulation of interleukin-12 production; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • positive regulation of interferon-gamma production; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • defense response to bacterium; • type I interferon signaling pathway; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • Фагоцитоз; • cellular response to lipopolysaccharide; • defense response to protozoan; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to interferon-gamma; • автофагія; • процес імунної системи;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3394
	15900
	ENSG00000140968
	ENSMUSG00000041515
	Q02556
	P23611
	NM_002163; NM_001363907; NM_001363908
	NM_001301811; NM_008320
	NP_002154; NP_001350836; NP_001350837
	NP_001288740; NP_032346
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IRF8 (англ. Interferon regulatory factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 48 356^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCDRNGGRRL	RQWLIEQIDS	SMYPGLIWEN	EEKSMFRIPW	KHAGKQDYNQ
EVDASIFKAW	AVFKGKFKEG	DKAEPATWKT	RLRCALNKSP	DFEEVTDRSQ
LDISEPYKVY	RIVPEEEQKC	KLGVATAGCV	NEVTEMECGR	SEIDELIKEP
SVDDYMGMIK	RSPSPPEACR	SQLLPDWWAQ	QPSTGVPLVT	GYTTYDAHHS
AFSQMVISFY	YGGKLVGQAT	TTCPEGCRLS	LSQPGLPGTK	LYGPEGLELV
RFPPADAIPS	ERQRQVTRKL	FGHLERGVLL	HSSRQGVFVK	RLCQGRVFCS
GNAVVCKGRP	NKLERDEVVQ	VFDTSQFFRE	LQQFYNSQGR	LPDGRVVLCF
GEEFPDMAPL	RSKLILVQIE	QLYVRQLAEE	AGKSCGAGSV	MQAPEEPPPD
QVFRMFPDIC	ASHQRSFFRE	NQQITV

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504