PTAFR — Вікіпедія

PTAFR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2B0X
Ідентифікатори
Символи	PTAFR, PAFR, platelet activating factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 173393 MGI: 106066 HomoloGene: 20260 GeneCards: PTAFR
Реагує на сполуку
	PAF
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor activity; • lipopolysaccharide binding; • signal transducer activity; • mitogen-activated protein kinase binding; • platelet activating factor receptor activity; • phospholipid binding; • lipopolysaccharide immune receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • secretory granule membrane; • tertiary granule membrane;
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of leukocyte tethering or rolling; • inositol trisphosphate biosynthetic process; • positive regulation of voltage-gated chloride channel activity; • positive regulation of phospholipase C activity; • negative regulation of blood pressure; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcytosis; • GO:0032617 cytokine production; • response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine; • response to symbiotic bacterium; • Цитопемпсис; • positive regulation of translation; • cellular response to gravity; • response to dexamethasone; • positive regulation of cellular extravasation; • positive regulation of maternal process involved in parturition; • хемотаксис; • cellular response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine; • positive regulation of sensory perception of pain; • response to lipopolysaccharide; • cellular response to fatty acid; • response to organophosphorus; • народження; • positive regulation of vasoconstriction; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of gastro-intestinal system smooth muscle contraction; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • inflammatory response; • positive regulation of smooth muscle contraction; • positive regulation of neutrophil degranulation; • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion; • phosphatidylinositol-mediated signaling; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • cellular response to cAMP; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor signaling pathway; • neutrophil degranulation; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5724
	19204
	ENSG00000169403
	ENSMUSG00000056529
	P25105
	Q62035
	NM_001164723; NM_000952; NM_001164721; NM_001164722
	NM_001081211
	NP_000943; NP_001158193; NP_001158194; NP_001158195
	NP_001074680
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTAFR (англ. Platelet activating factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 203^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPHDSSHMD	SEFRYTLFPI	VYSIIFVLGV	IANGYVLWVF	ARLYPCKKFN
EIKIFMVNLT	MADMLFLITL	PLWIVYYQNQ	GNWILPKFLC	NVAGCLFFIN
TYCSVAFLGV	ITYNRFQAVT	RPIKTAQANT	RKRGISLSLV	IWVAIVGAAS
YFLILDSTNT	VPDSAGSGNV	TRCFEHYEKG	SVPVLIIHIF	IVFSFFLVFL
IILFCNLVII	RTLLMQPVQQ	QRNAEVKRRA	LWMVCTVLAV	FIICFVPHHV
VQLPWTLAEL	GFQDSKFHQA	INDAHQVTLC	LLSTNCVLDP	VIYCFLTKKF
RKHLTEKFYS	MRSSRKCSRA	TTDTVTEVVV	PFNQIPGNSL	KN

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Ye R.D., Prossnitz E.R., Zou A., Cochrane C.G. (1991). Characterization of a human cDNA that encodes a functional receptor for platelet activating factor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 180: 105—111. PMID 1656963 DOI:10.1016/S0006-291X(05)81261-6
Seyfried C.E., Schweickart V.L., Godiska R., Gray P.W. (1992). The human platelet-activating factor receptor gene (PTAFR) contains no introns and maps to chromosome 1. Genomics. 13: 832—834. PMID 1322356 DOI:10.1016/0888-7543(92)90162-L
Chase P.B., Halonen M., Regan J.W. (1993). Cloning of a human platelet-activating factor receptor gene: evidence for an intron in the 5'-untranslated region. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 8: 240—244. PMID 8383507 DOI:10.1165/ajrcmb/8.3.240
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kunz D., Gerard N.P., Gerard C. (1992). The human leukocyte platelet-activating factor receptor. cDNA cloning, cell surface expression, and construction of a novel epitope-bearing analog. J. Biol. Chem. 267: 9101—9106. PMID 1374385